歷任校長

第一任余饒理校長英國基督長老教會選定台南，創辦台灣第一所西式中學「長老教中學」，即為今日「長榮高級中學」的前身。首屆學生二十二人。第一任校長余饒理先生。初期校址位於府城二老口街，即今萬鍾社區的衛民街口。 1896年，光緒21年，台灣割讓給日本。
第二任費仁純校長 1901年光緒27年費仁純先生被英國教會　任命第二任校長。本校的教育方式更趨向多元化。 1906年獲得台灣總督府的設立認可證。
第三任萬榮華校長位於東門城郊現今校址上之新校舍開始動工興建， 1916年正式遷入現址。萬校長任期內，注重科學、英語、體育，同時重視基督教的人格教育。提倡西式運動首度將足球運動引進台灣。
第四任加藤長太郎校長 1935年加藤長太郎到任第四任校長。 1939年6月21日「長老教中學」通過正式立案為「長榮中學校」。 7月15日隆重舉行開校典禮。成立各種社團推廣棒球，桌球，書法等課程。足球隊遠征日本甲子園。 1941年日本偷襲珍珠港爆發太平洋戰爭。
第五任趙天慈校長第二次世界大戰結束。 1945年趙天慈校友接任第五任校長。 1947年成立南台灣第一個橄欖球隊。 1949年舊台幣換新台幣學校經濟陷入困苦深淵。 1951年趙天慈校長堅請退休。
第六任戴明福校長省立台東中學校長戴明福返回母校接任第六任校長。致力維護宗教活動和提高升學率。克服經濟困難、強化校友會功能、增建平房教室。廣收學生、推行體育運動、舉辦升學輔導等，奠定校務良好的根基。 1966年橄欖球隊粉碎建中蟬連二十連霸的美夢拿下全省高中冠軍。 1968年九年國民義務教育實施。 1969年附設補校。 1971年首次招收女生。
第七任蘇進安校長 1973年蘇進安博士回母校接任校長。任內竭盡全力，整頓校舍、美化校園。依照歐洲羅馬式拱形建築之特殊風格，積極興建現代的教學大樓。先後完成各科教學大樓、實習大樓、教職員公寓和　幼教大樓。高職部開辦首先增設商業經營科。 1974年成立電工科，1986年改為電機科。 1975年設立機械製圖科，2000年改為製圖科。 1977年設立美工科。
第八任蔡忠雄校長 2000年蔡忠雄博士接任校長任內致力教育工作，建置蝴蝶館、椰林藝廊、創校120週年紀念鐘塔、林茂生文物館、室內攀岩場拆除行政大樓與普科大樓的「平房」，增闢為紅磚步道與綠地，使校園綠地更為開闊先後增設應用外語科、廣告設計科、觀光事業科 2003年承辦92全國中等學校運動會競賽記錄組工作 1975年設立機械製圖科，2000年改為製圖科。 2003年承辦92學年高中學生新世紀領導人才南區初階培育營 2005年當選台南市教育會理事長，並獲評比二年甲等及一年優等的亮麗成績 2005年完成慶祝創校120週年紀念感恩心聖火繞台灣聖火隊創舉 2005年與董事會完成「英國尋根之旅」，探訪宣教師的故鄉 2007年承辦台南市政府96全國運動會競賽紀錄組工作 2009年教師節獲頒中華民國私教學會弘道獎 2009年橄欖球隊榮獲97年度中正盃、第63屆全國橄欖球錦標賽、98年全國七人制三項冠軍 2010年推動e 化教學，完成所有高中職班級e化設備裝設
第九任王昭卿校長 2010年王昭卿校長繼任第九任校長 2011年台灣長榮中學校友會總會正式立案 2011年核准增設「多媒體設計科」 2012年增設「國際事務中心」 2012年國、高、職一年級學生制服重新設計更換 2013年與韓國首爾市養正高中締結為姊妹學校 2013年與美國德州泛美中學結為姊妹學校 2013年核准增設「流通管理科」與「機電科」 2014年與日本靜岡縣盛岡中學簽訂締結姐妹校 2016年第二實習大樓動土感恩禮拜 2016年與泰國王子皇家學院簽訂姐妹校 2016年與日本近江兄弟社高等學校簽訂姐妹校 2018年第二教學實習大樓興建完成，開始規劃內部設計，以配合108新課綱的實施。